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2003年这种分类法出版了修订版《被子植物APG II分类法 (修订版)》，2009年又出版了 APG III，2016年更新到 APG IV。

1970年代之后，被子植物的分类系统似乎到达一个稳定的状态，借助于新技术从事传统的分类学研究，并由于此类资料的大量累积，当时仍极为常用的克朗奎斯特分类法及塔赫塔江分类法渐渐显得过时。加上当时许多研究，涉及了分子技术的引用，为许多分类群提供了明确的种系发生学上的数据。即使亚美因·塔赫塔江亦投注极大的心力于其系统的完善，但被子植物分类学上一个新的种系发生学的面相应被重新提出，尤其针对科与目等高阶分类群的分类。植物种系发生学组于是提出此APG系统。

APG (1998年)选择相当数量的单源的亚科分类群，如此对于被子植物的高阶分类极有为用。但对于此分类群的正式分类处理，与予以种系发生学上的命名实则不同，命名上当时仍存在诸多争议。APG采用了《国际植物命名法规》的方式，为科级及目级的分类群命名。

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罗杰·大卫·科恩伯格，美国生物化学家，斯坦福大学结构生物学教授。因其对“真核转录的分子基础所作的研究”而荣获2006年诺贝尔化学奖。他的父亲阿瑟·科恩伯格也是斯坦福大学的教授，并且是1959年诺贝尔生理学或医学奖获得者。

1947年出生于密苏里州圣路易市。1967年，科恩伯格毕业于哈佛大学，获得学士学位，1972年于斯坦福大学获得博士学位。曾经在位于剑桥的英国医学研究理事会分子生物学实验室做博士后研究。在担任斯坦福大学教授之前，他曾经任教于哈佛医学院生物化学系。他对「真核生物的DNA转录机制」钻研超过三十年，累积的研究成果对于了解干细胞的分化、人类疾病的机制等重要医学问题，提供重要基础。

科恩伯格是美国国家科学院（United States National Academy of Sciences）和美国艺术与科学研究院（American Academy of Arts and Sciences）院士。他还是世界顶尖科学家协会主席。

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