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更新于 2026-10-22

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假结结构(pseudoknot)是一类RNA三级结构。假结结构包含至少两个茎环结构。其中,一个茎环结构的茎的一半插入了另一个茎环结构的茎结构中。假结结构最初于1982年在Turnip yellow mosaic virus中发现。假结结构折叠成类似于绳结的三维结构,但却并不是真正的拓扑学的结。

假结结构很难被计算生物学的检测手段查出,因为其对所在环境相当敏感,且具有「重叠的」本质。假结结构的碱基对的嵌入较差,即碱基对与其他的碱基对有一定重叠。这使得通过标准的动态规划方法对RNA序列中可能存在的假结结构的预测变得更加困难。动态规划通过一个递推记分系统来确认配对的茎结构,因而很难测出非嵌入的碱基对。更新的随机上下文无关文法也面临相同的问题。因此,像 Mfold和 Pfold这样的流行的二级结构预测方法并不能预测出目标序列中的假结结构。它们只能确认更稳定的假结结构中的两个茎。

可以通过动态规划的方法确认某些类型的假结结构,但这类方法不够详尽,而且在作为序列长度的函数时与进行与假结无关的算法时测量表现较差。一个困扰许多预测最低的自由能的方法的问题是NP完全。

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相关阅读:假结结构

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十里河,位于中华人民共和国辽宁省中部的一条河流,是北沙河左岸支流,发源于灯塔市柳河子镇红旗沟村东北的八盘岭,向西流经柳河子镇,于大河南镇营盘村起成为灯塔市与沈阳市苏家屯区之间的界河,流经灯塔市的大河南镇和苏家屯区十里河街道,最后于大河南镇东羊角湾村以北汇入北沙河。河流全长41.19千米,流域面积202平方千米,年均径流量0.345亿立方米。十里河沿岸农业发达,盛产大米、蔬菜等优质农产品。

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茨河,古称“细水”,位于河南省东部、安徽省西北部,原为颍河左岸支流,1980年茨淮新河通水后,在安徽省阜阳市茨河铺分洪闸下入茨淮新河,成为茨淮新河左岸支流。全长185公里,流域面积2994平方公里。其中茨河上游河南省境内称为黑河,长100公里,流域面积1738平方公里。黑河古称“瀖河”,又名“琵琶沟”,发源于河南省太康县西部逊母口镇姜庄村,东南流经淮阳县东北部、鹿邑县西南部、郸城县北部和东部,至郸城县东南白马镇张胖店村流入安徽省太和县后始称“茨河”,茨河纵贯太和县中部,东南流入阜阳市颍泉区,至茨河铺注入茨淮新河。途纳李贯河、晋沟河、谷河等支流。

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