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在计算生物学中,N50和L50是Contigs(重叠群)或脚手架长度的统计值。N50的计算方式类似于平均值或中位数,但是对长Contigs的权重更大。这种方法广泛运用于序列组装中,特别是在参考组装草稿内的Contigs长度中。这种度量常被用来描述基因组装配(有时还有其他装配)的“完整性”。但它的本质是告诉你一些关于Contigs长度分布的信息。
N50根据连续性定义装配质量。按照序列长度的顺序排列你的集合中的所有Contigs。首先是最长的Contigs,然后是第二长的Contigs,最后是最短的Contigs。然后,从一开始累加所有Contigs的长度,这样您就可以得到最长的Contigs+第二长的Contigs+第三长的Contigs,以此类推,直到达到占总装配长度50%的数字,即为N50。N50可以近似的看作分布质量一半的点:比N50长的所有Contigs的碱基数于比N50短的所有Contigs的碱基数在数值上是接近的。
L50定义为,在给定一组Contigs的情况下,长度总和占基因组大小一半的最小Contigs数。
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4.d1997年设立重庆直辖市前之地级涪陵市,范围含涪陵区、丰都县、垫江县、武隆县、南川市。
5.e襄樊市市辖区居委会人口2,723人、村委会人口145,830人、其他基层行政单位人口405,493人,总计554,046人。(90年普查)
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舟山之役,清世祖顺治八年(1651年)七月至九月,清朝平南将军金砺等率军攻克鲁王朱以海所据舟山岛的作战。
舟山为南明鲁王朱以海流亡海上的最后基地。1651年二月,南明鲁王部将张名振杀王朝先,王朝先部将张济明投降清朝,将舟山虚实全部告知清军。清朝闽浙总督陈锦决定进兵舟山。七月,平南将军固山额真金砺、固山额真刘之源、闽浙总督陈锦、提督田雄等,分道进攻舟山。
鲁王朱以海派大学士张肯堂留守舟山,派阮进守横水洋(金塘山岛与舟山岛之间),自己随张名振总督水军,出吴淞作牵制。清军从定关出海,在横水洋与阮进的舟师大战斗,阮进被擒,清军至舟山。张肯堂率军民坚守,左都督张名扬统兵力战。九月初八日,城中力竭,清军掘地道破城,张肯堂、张名扬自尽。张名振听说舟山城破,保护鲁王到金门岛,依附郑成功。
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