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岩石自养生物在其还原化合物来源方面极为特殊，因此，尽管岩石自养生物作为一类群体在使用无机化合物方面呈现出多样性，但一种特定的岩石自养生物只会利用一种类型的无机分子来获取能量。一则化学能自养的示例是浮霉菌门厌氧氨氧化菌(ANAMMOX)，它使用亚硝酸根将氨离子氧化为氮气(N2)。此外，在2020年7月，研究人员报告了在进行无关实验后发现的以金属锰为食的化能自养菌培养物，并将该菌种命名为“候选者锰营养型结节状菌”(Candidatus Manganitrophus noduliformans)和“拉姆利氏岩石自养杆菌”(Ramlibacter lithotrophicus)。

一些化能无机自养生物使用氧化还原半反应进行新陈代谢，还原电位较低，这意味着与使用有机营养途径的生物体相比，它们不会获得很多能量，这导致一些化能无机营养因子，如“亚硝基单胞菌”，无法直接降低烟酰胺腺嘌呤二核苷酸，即“辅酶Ⅰ”(NAD+)。因此，这些生物体依靠反向电子传递来减少辅酶Ⅰ，形成还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)和氢离子(H)。

岩石自养生物参与了许多地质作用过程，例如母质(岩床)风化形成土壤，以及硫、钾和其他元素的生物地质化学循环。未发现的微生物自养菌株的存在是基于其中的一些循环理论，因为需要它们来解释铁还原环境中的铵转化等现象。岩石自养生物可能存在于地下深层(被发现于地球地表下3千米以下处)、土壤和岩内生物群落中。由于它们承担释放许多关键养分的作用，并参与土壤形成。因此，岩石自养生物对维持地球生命至关重要，例如，氮循环就受到硝化螺菌属氨氧化古菌、厌氧氨氧化菌和完全氨氧化菌(COMAMMOX)活性的影响。

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