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台湾特有，局限分布南台湾高雄寿山西海岸、旗后山及屏东琉球屿等地，一般生长在临海珊瑚礁石灰岩上，所处环境终年日照强烈。

本种最初由早田文藏于1911年引证川上泷弥、中原源治于1906年采自打狗（现今高雄）的标本发表新种（模式标本现典藏于日本东京大学植物标本馆），当时被归入还阳参属（学名：Crepis L.），使用学名Crepis formosana Hayata，并描述其形态近似Crepis japonica（现为Y. japonica japonica同物异名），唯本种叶片具备独特的天鹅绒质感（原文：Near C. japonica BENTH., from which the present plant differs in having velvety leaves.）。该学名随后于1933年、1936年、1937年、1938年陆续被降阶做种下分类群，或改列入黄鹌菜属（学名：Youngia Cass.）。1998年《台湾植物志第二版》出版时，菊科主编彭镜毅、钟国芳、李惠林采纳北村四郎于1937年的分类观点，视本种为东亚广布种黄鹌菜（学名：Y. japonica (L.) DC.）于台湾的特有亚种，使用学名Y. japonica subsp. formosana (Hayata) Kitam.，并描述本种普遍分布本岛海拔1500至2500公尺山区。值得注意的是，《台湾植物志第二版》对本种地理分布之描述与早田文藏已有明显差异，故台湾植物学者曾有段时间认为Y. japonica subsp. formosana (Hayata) Kitam.为主要分布本岛中海拔山区的特有亚种。

约莫2010年或更早，静宜大学陈玉峰教授等人探查高雄寿山西海岸期间，发现该地珊瑚礁岩上生长著一种形态特殊、疑似从未被正式描述的黄鹌菜属植物。随后经中研院彭镜毅教授团队取样研究，2012年完成对台湾所有黄鹌菜属植物的分子亲缘分析，确认该不知名黄鹌菜与黄鹌菜（学名：Y. japonica (L.) DC.）关系紧密，应为其亚种，与指名亚种之间的分化事件可能源自更新世晚期或更为晚近。彭教授团队于该过程重新检视台湾所有黄鹌菜属植物模式标本，进而发现《台湾植物志第二版》所称Y. japonica subsp. formosana (Hayata) Kitam.与早田文藏于1911年发表的C. formosana Hayata并非相同植物，前者特产本岛中海拔山区、植株体型较大、叶质地光滑，后者局限分布南台湾珊瑚礁海岸、植株体型较小、叶带天鹅绒质感。基于命名法规里的优先原则，台湾黄鹌菜（Y. japonica subsp. formosana (Hayata) Kitam.）一名被保留给后者，即早田曾于1911年描述的植物，前者则改称山间黄鹌菜（Y. japonica subsp. monticola K. Nakam. & C.-I Peng）。

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