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伯克氏菌属的细菌过去皆归属于假单胞菌属，后来基于rDNA序列的研究，与其他六个属一起从假单胞菌属中独立出来。在伯克氏菌属中，唐菖蒲伯克氏菌与Burkholderia cepacia complex（包含十种物种，皆为植物病原菌）关系最接近，也常与该菌群的种类混淆。唐菖蒲伯克氏菌分为gladioli、allicola和agaricicola等三种pathovar。其中gladioli导致唐菖蒲腐烂、allicola导致洋葱鳞茎腐烂、agaricicola导致蘑菇软腐病。
伯克氏菌为可移动的革兰氏阴性菌，属于好氧的杆菌，过氧化氢酶检测与脲酶检测结果均为阳性，不形成内孢子，它们可在马康基氏琼脂上生长，但不能发酵乳糖。唐菖蒲伯克氏菌与其他种伯克氏菌的区别是其氧化酶测试结果阴性、Indole test结果为阴性、棕色环试验结果为阴性、Lysine decarboxylase测试结果则为阴性。PCR可用于在分子层次上鉴别不同的伯克氏菌属物种，一般以16S或23SrDNA的序列差异区分物种。
唐菖蒲伯克氏菌是洋葱、唐菖蒲、鸢尾中的植物病原菌，可引起唐菖蒲的球茎与叶浸水腐烂，并出现边缘带黄色的棕色病斑，病斑一段时间后会脱落，造成孔洞，另外本种菌感染还可造成叶鞘（leaf sheath）褐变，以及根、茎和花瓣等部位也可能枯萎腐烂，最终全株皆可能凋萎。
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