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在十五年的时间里，由于查理忙于同法国和奥斯曼帝国作战，联盟没有受到任何挑战。奥斯曼-哈布斯堡战争从1526年持续到了1571年。1535年，查理成功征服突尼斯。弗朗索瓦一世为抵抗哈布斯堡王朝，同苏莱曼大帝结盟，形成了法国-奥斯曼帝国联盟。1535年至1538年在法国和神圣罗马帝国间展开的意大利战争由1538年的尼斯和约完结。在这段时间里查理同法国的最后一次战争——1542年至1544年意大利战争没有分出胜负，以克雷皮和约完结。
在同弗朗索瓦议和之后，查理开始专注于镇压帝国内的新教运动。从1546年至1547年，在施马尔卡尔登战争中，查理及其盟友同联盟为恩斯特系萨克森和阿尔布雷希特系萨克森的领土展开交战。虽然联盟在军力上占优，但其领袖却缺乏能力，并无法在战争计划上达成一致。虽然教宗保禄三世从帝国中撤军并将补贴金减半，在1547年4月24日，查理的帝国军队仍然在Battle of Mühlberg中击溃联盟军，并俘获了诸多联盟领袖，包括约翰·弗里德里希。菲利普试图进行谈判，但被查理拒绝，于是他也于5月投降。从理论上来说，三十个城市就此回归天主教，但事实上并非如此。这一战基本上奠定了查理在这一战争中的胜局：只有两座城市仍然在进行抵抗。许多诸侯和改革者（如马丁·比塞）则逃到了英格兰，并直接对英格兰宗教改革产生了影响。
1548年，查理逼迫施马尔卡尔登联盟接受了《奥格斯堡临时敕令》中的条款。然而到了16世纪50年代，路德宗已经在中欧站稳了脚跟，凭皇帝的武力已经无法改变这一局面。藉著与法王亨利二世的联盟（法国在1551年重新对查理五世开战，最后一次的义大利战争于1559年才结束），1552年，与查理结盟的新任萨克森选侯莫里茨出乎意料的背叛了皇帝，并向皇帝发起进攻，开启了「第二次施马尔卡尔登战争」（1552-1555年）。新教势力的暴升与出乎意料的反击，取得关键性的小胜，并迫使查理逃离蒂罗尔；疲于德意志地区三旬征战的查理，为了集中兵力对付法军，决定对新教徒让步，签订了《Peace of Passau》，给予新教徒一定的自由，并使查理在帝国内统一信仰的希望彻底破灭。三年之后的《奥格斯堡和约》则使路德宗在神圣罗马帝国中获得了正式的地位，诸侯可以自由选择其领地的宗教信仰。
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基质金属蛋白酶（Matrix metalloproteinase）是钙依赖性的含锌内肽酶，属于金属蛋白酶。其他类似的内肽酶有adamalysin、serralysin及astacin。基质金属蛋白酶属于蛋白酶中一个较大的家族，称为metzincin superfamily。
这些酶类可以分解各种细胞外基质的蛋白质，不过也可以处理一些生物活性分子。目前已知这些酶类参与细胞表面一些受体的分解、释放细胞凋亡配体（例如FAS配体）以及趋化因子/细胞因子的去活化。一般认为基质金属蛋白酶在许多细胞行为中扮演重要的角色，例如细胞增殖、细胞迁移、（细胞粘附/分散）、细胞分化、血管新生、细胞凋亡及免疫系统。
基质金属蛋白酶最早是在脊椎动物身上发现（1962），其中人类身上也有，不过在无脊椎动物及植物身上也曾发现有此酶类。它们和其他 内肽酶的差异是它们依赖金属离子为辅因子、可以分解细胞外基质的能力。以及它们特定的进化DNA序列。
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