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早期对于球囊菌门的研究多半著重在其型态及土壤中、菌根内外孢子堆的构造「球囊菌门」的概念最早是在原囊霉属（Acaulospora）及Gigaspora两个属被提出，并和接合菌门Endogonaceae下的Glomus属共同被提升为科，合为球囊霉目（属于接合菌门）。1998年Cavalier与Smith提出「球囊菌纲（Glomomycetes）」的概念，并将球囊霉目归入其中（仍属接合菌门）。后来经Schüßler对该目下部分物种小亚基rRNA（SSUrRNA）的分析发现球囊菌目可自组一个门，便将其由接合菌门移出，新成立「球囊菌门」，又因发现有能产生类似球囊霉目孢子的种类应该属于另一个更分歧的种系，而新增了类球囊霉目（Paraglomerales）、原囊霉目（Archaeosporales）与多孢囊霉目（Diversisporales）三个目，与念珠藻（Nostoc punctiforme）形成丛枝菌根的Geosiphon pyriformis即属于原囊霉目。

现在的分类即是透过分子生物学的分析，不断修正才定出的。对于本门物种的分类研究尚未完成，有待继续研究，例如有些研究认为Glomus属下的许多物种应被分到其他科或属比较合适。

有研究分析各种真菌rDNA的序列，发现球囊菌门在演化上是双核亚界的姊妹群。

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袁定阳，袁隆平第三子，中国大陆农学家，广西大学、湖南农业大学和香港中文大学肄业，现在是杂交水稻国家重点实验室副主任、湖南杂交水稻研究中心和湖南农业大学研究员。

1970年3月14日出生。1990年，袁定阳考入广西农业大学（今广西大学），学习农学专业，1994年毕业后进入湖南杂交水稻研究中心工作，直到1999年。1996年，袁定阳考入湖南农业大学，学习作物遗传育种专业，1998年取得硕士学位。2001年，袁定阳进入香港中文大学学习分子生物学专业学习，取得博士学位。毕业后，袁定阳在香港中文大学生物学从事博士后工作。2008年起，袁定阳先后出任湖南杂交水稻研究中心副研究员、研究员。现在是杂交水稻国家重点实验室副主任。

* 女儿：袁有清、袁有明（袁隆平取名，清代表雨水、明代表阳光）

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