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阿雷佐的圭多(Guido of Arezzo,991/992年 – 1033年之后),也称圭多·达莱佐(Guido d'Arezzo)或圭多·莫纳科(Guido Monaco),意大利中世纪音乐理论家,常被认为是现代音乐记谱法(五线谱)的发明者。早年曾在科迪戈罗的彭波萨修道院求学,1025年因修道院僧侣反对他的音乐革新而离开彭波萨。后受阿雷佐主教泰达尔德之聘任大教堂学校教师,并受托写出了《辨及微芒:音乐理论剖析》(Micrologus de Disciplina Artis Musicae)一书。
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有效编码假设,是由Horace Barlow 于1961年为脑的sensory coding提出的一个理论模型。 在脑中,神经元通过传递一些电脉冲进行联系,这种电脉冲被称作动作电位或者神经冲动。感觉神经科学的一个目标,就是解码这些动作电位的意义,以便理解脑是如何表现和处理外部世界的信息。巴罗假设,感觉系统的动作电位形成了神经编码用来有效地表达感觉信息。 巴罗所说的“有效”,指的是神经编码会使得传递一个给定信号所需要的动作电位数量最少。 这有点类似在互联网上传递信息,可以使用不同的文件格式来传送同一张图片。对于同一张图片来说,使用不同的文件格式会需要不同的比特数来达到同样的分辨率。这个模型认为,脑会使用适合表达生物生活的自然环境的视觉和听觉信息的编码。
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染色质免疫沉淀-测序(ChIP-sequencing,简称为ChIP-seq)被用于分析蛋白质与DNA的交互作用。该技术将染色质免疫沉淀(ChIP)与大规模并行DNA测序结合起来以鉴定与DNA相关蛋白的结合部位。其可被用于精确绘制任意目的蛋白在全基因组上的结合位点。在此之前,ChIP-on-chip是研究这些蛋白-DNA联系的最常用的技术。
ChIP-seq主要用于确定转录因子和其他染色质相关蛋白质如何影响表型影响机制。确定蛋白质如何与DNA相互作用来调控基因表达对于充分了解许多生物过程和疾病状态至关重要。这种表观遗传信息与基因型和表达分析是互补的。 ChIP-seq技术目前主要被看作是需要杂交阵列的ChIP-on-Chip的替代品。 这必然会引入一些偏差,因为一个阵列仅限于有固定数量的探针。相反,尽管不同测序技术的测序偏差尚未完全了解,测序被认为偏差较小。
与转录因子和其他蛋白质直接物理相互作用的特定DNA位点可通过染色质免疫沉淀被分离出来。 ChIP产生在活体内In vivo兴趣蛋白质结合的目标DNA位点文库。 大规模平行序列分析与全基因组序列数据库结合使用来分析任何蛋白质与DNA的相互作用模式或任何表观遗传染色质修饰的模式。 这可以应用于一系列ChIP蛋白和修饰,如转录因子,聚合酶和转录机制,结构蛋白质,蛋白修饰和DNA修饰。 作为对特异性抗体依赖性的替代方法,已经开发了不同的方法来发现基因组中所有核小体耗尽的(nucleosome-depleted)或核小体扰动(nucleosome-disrupted)的活性调控区的超集,如DNase-Seq和FAIRE-Seq。
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