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1922年回国担任国立东南大学（1928年改名国立中央大学，1949年改名南京大学）生物系教授，1926年起担任清华大学生物系教授兼系主任，1927年任北京师范大学生物系教授，1928年任中央大学教授。1929年至1937年担任清华大学生物系教授兼系主任，1938年至1946年担任西南联合大学教授，1946年起复任清华大学生物系教授兼系主任，其间曾于1947年兼任联合国教育科学文化组织中国委员会第一届委员。1948年，当选为中央研究院第一届院士。

1949年中华人民共和国成立后，他续任于清华大学生物系。1952年清华大学生物系并入北京大学，他担任合并后的北京大学生物系教授，并兼任中国科学院动物标本工作委员会主任委员。1953年起担任中国科学院动物研究室主任，1955年获选为中国科学院院士（学部委员），1957年动物研究室改制为动物研究所，由他担任所长。同年11月病逝于北京。

他长期投入于金鱼遗传与变异、动物行为学、生物学史等研究工作，是中国较早的现代生物学者及教育家，也是中国动物遗传学的创始人。

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在台湾为外来入侵种，最早于1992年在高雄发现，已在台湾西南部建立野外族群。

一般常出没于农耕地、果园；也会在房屋周围及路旁草丛活动。其生存的海拔范围为42至1560米。

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